| Kepala Pusat Intelegensia Buatan (Artificial Intelligence) | Dr. Eng. Ayu Purwarianti, S.T., M.T. |
| Kepala Pusat Infrastruktur Data Spasial | - |
| Kepala Pusat Inovasi Kota dan Komunitas Cerdas | Prof.Dr.Ir. Suhono Harso Supangkat, M.Eng. |
| Kepala Pusat Kajian Halal | Prof. Dr. Zeily Nurachman, M.S. |
| Kepala Pusat Kebijakan Keenergian | - |
| Kepala Pusat Kebijakan Publik dan Kepemerintahan | - |
| Kepala Pusat Mikroelektronika | Prof. Ir. Arif Sasongko, S.T., M.T., Ph.D. |
| Kepala Pusat Open Source Software | Dr. Ir. Eko Mursito Budi, M.T. |
| Kepala Pusat Pemberdayaan Perdesaan | Husna Nugrahapraja, S.Si., M.Si., Ph.D. |
| Kepala Pusat Pemodelan Matematika dan Simulasi | Prof. Dr. Nuning Nuraini, S.Si., M.Si. |
| Kepala Pusat Pengembangan Sumber Daya Air | - |
| Kepala Pusat Pengembangan Wilayah Pesisir dan Laut | - |
| Kepala Pusat Pengindraan Jauh | - |
| Kepala Pusat Pengkajian Logistik dan Sistem Rantai Pasok | Suprayogi, S.T., M.T., Ph.D. |
| Kepala Pusat Perencanaan dan Pengembangan Kepariwisataan | Ir. Budi Faisal, M.A.U.D., M.L.A., Ph.D. |
| Kepala Pusat Perubahan Iklim | Prof. Ir. Djoko Santoso Abi Suroso, Ph.D. |
| Kepala Pusat Rekayasa Industri | - |
| Kepala Pusat Rekayasa Katalisis |
Prof. Dr. Ir. Melia Laniwati Gunawan, M.S. |
| Kepala Pusat Studi Agraria | - |
| Kepala Pusat Studi Lingkungan Hidup | Prof. Ir. Indah Rachmatiah Siti Salami, M.Sc., Ph.D. |
| Kepala Pusat Studi Sistem Tak Berawak | Prof. Dr. Ir. Bambang Riyanto Trilaksono |
| Kepala Pusat Teknologi Instrumen dan Otomasi | - |
| Kepala Pusat Teknologi Kesehatan dan Keolahragaan | Dr. Hasballah Zakaria, S.T., M.Sc. |
| Kepala Pusat Teknologi Teknologi Pertahanan dan Keamanan | Dr. rer. nat. Mardiyati, S.Si., M.T. |
| Kepala Pusat Teknologi Transportasi Berkelanjutan |
Prof. Ir. I Gusti Nyoman Wiratmaja, Ph.D. |
| Kepala Pusat Pemanfaatan Karbon Dioksida dan Gas Suar |
Dr. rer. nat. Ir. R. Mohammad Rachmat, S.T., M.T. |
| Kepala Pusat Sains, Teknologi, dan Inovasi Keantaraiksaan |
Prof. Dr. Taufiq Hidajat, D.E.A. |
| Kepala Pusat Sains, Teknologi dan Inovasi Nuklir | Prof. Dr. Zaki Su’ud, M.Eng. |
| Kepala Pusat Analisis dan Penerapan Geospasial | Dr. Ir. Wedyanto, M.Sc. |