| Kepala Pusat Penelitian Energi Baru dan Terbarukan | Prof. Ir. Ari Darmawan Pasek, Ph.D. |
| Kepala Pusat Penelitian Infrastruktur dan Kewilayahan | Prof. Dr. Delik Hudalah, S.T., M.T., M.Sc. |
| Kepala Pusat Penelitian Mitigasi Bencana | Prof. Dr.Sc. Ir. Andri Dian Nugraha, S.Si., M.Si. |
| Kepala Pusat Penelitian Biosains dan Bioteknologi | Ir. V. Sri Harjati Suhardi, Ph.D. |
| Kepala Pusat Penelitian Nanosains dan Nanoteknologi | Prof. Dr. Veinardi Suendo, S.Si., M.Eng. |
| Kepala Pusat Penelitian Produk Budaya dan Lingkungan | Dr. Adhi Nugraha, M.A. |
| Kepala Pusat Penelitian Teknologi Informasi dan Komunikasi | Dr. Yoanes Bandung, S.T., M.T. |