| Kepala Pusat Penelitian Biosains dan Bioteknologi | - |
| Kepala Pusat Penelitian Energi Baru dan Terbarukan | Prof. Dr.Ing. Ir. Priyono Soetikno, DEA. |
| Kepala Pusat Penelitian Infrastruktur dan Kewilayahan | Wilmar A. Salim, DEA. |
| Kepala Pusat Penelitian Mitigasi Bencana | Prof. Ir. Iswandi Imran, MA., Sc., Ph.D. |
| Kepala Pusat Penelitian Nanosains dan Nanoteknologi | Prof. Dr. Heni Rachmawati, Apt., M.Si. |
| Kepala Pusat Penelitian Produk Budaya dan Lingkungan | Dr. Muhammad Ihsan D.R.S.A.S., S.Sn., M.Sn. |
| Kepala Pusat Penelitian Teknologi Informasi dan Komunikasi | Dr. Ary Setijadi Prihatmanto, S.T., M.T. |