Program Magister Teknik Kelautan didirikan pada tahun 2002 sebagai program khusus dibawah Jurusan Teknik Sipil. Pada tahun 2005, seiring dengan reorganisasi ITB, program Magister ini pun menjadi program pascasarjana dibawah Fakultas Teknik Sipil dan Lingkungan.
Perkembangan Indonesia dalam bidang pesisir dan lepas pantai membutuhkan tenaga ahli yang memiliki spesialisasi di bidang perairan Indonesia. Untuk memenuhi kebutuhan tenaga ahli ini, Program Magister Teknik Kelautan menawarkan mata kuliah dan peluang penelitian terkait lingkungan dan keteknikan infrastruktur pesisir dan lepas pantai. Saat ini, program studi menawarkan dua bidang studi khusus, yaitu Teknik Pesisir dan Lepas Pantai. Penelitian yang sedang berlangsung berkonsentrasi pada pengembangan dan penerapan dua bidang tersebut. Penelitian ini mencakup berbagai topik seperti, Erosi Pantai dan Perlindungan Pesisir, Stabilitias Struktur Pesisir, Desain Pelabuhan, Pemodelan Lingkungan Laut, Pengukuran Lingkungan Laut, Respon Dinamis Struktur Lepas Pantai, Pemantauan Platform Basis Respon, Penilaian Keandalan Platform untuk Pengunaan Kembali dan Sertifikasi Ulang, serta Desain dan Pemasangan Pipa Bawah Laut.